Спортивні команди університету представлені під назвою York Lions. Діють секції футболу, баскетболу, волейболу, плавання, тенісу, хокею та багатьох інших видів спорту.

Спортивні споруди університету включають футбольний стадіон, 4 спортзали, 5 спортивних майданчиків, 4 софтбольних майданчики, 9 тенісних кортів, 5 сквош-кортів, 3 танцювальні/аеробні студії, 6 льодових арен, басейн та розширений фітнес-центр.

В університеті діють 29 міжуніверситетських спортивних команд, 12 спортивних клубів, 35 внутрішніх спортивних ліг. Проводяться спеціальні заходи та щоденні заняття спортом.

У 2014 році York Lions виграли чотири чемпіонські титули: національний чемпіонат серед чоловіків з легкої атлетики, провінційний чемпіонат серед жінок з тенісу та обидва чемпіонські титули серед чоловіків з футболу. У 2015 та 2016 роках жіноча тенісна команда York Lions виграла Канадський університетський національний чемпіонат.

York University має понад 350 студентських клубів, які охоплюють широкий спектр інтересів та діяльностей.

Деякі з великих студентських організацій підтримуються студентськими внесками. Приклади таких організацій — місцеві відділення соціальної групи OPIRG та екологічної організації Regenesis, яка організовує фермерські ринки на кампусах та безкоштовний магазин.

В університеті діє велика кількість академічних спільнот, клубів за професійними інтересами, культурних клубів, майданчиків з обговорення суспільних питань, клубів підтримки різноманітності та інклюзії, гуртків за інтересами (наприклад, шахи, дебати, філософія) тощо.

Університет пропонує багатий вибір творчих секцій, які сприяють розвитку мистецьких талантів студентів.